Área de Proteção Ambiental Costa das Algas

Área de Proteção Ambiental do Arquipélago de São Pedro e São Paulo

Área de Proteção Ambiental Marinha do Litoral Norte

Área de Proteção Ambiental Mestre Álvaro

Estação Ecológica de Angatuba

Estação Ecológica de Assis

Estação Ecológica de Avaré

Estação Ecológica de Bananal

Estação Ecológica de Maracá

Estação Ecológica de Santa Bárbara

Estação Ecológica dos Caetetus

Floresta Nacional Contendas do Sincorá

Floresta Nacional do Rio Preto

Floresta Nacional do Tapajós

Monumento Natural do Arquipélago das Ilhas Cagarras

Monumento Natural Municipal da Lagoa do Peri

Parque Estadual Carlos Botelho

Parque Estadual da Costa do Sol

Parque Estadual da Pedra Azul

Parque Estadual da Pedra Selada

Parque Estadual da Serra da Concórdia

Parque Estadual de Porto Ferreira

Parque Estadual do Forno Grande

Parque Estadual Mata das Flores

Parque Estadual Paulo César Vinha

Parque Estadual Turístico do Alto Ribeira

Parque Nacional da Serra do Divisor

Parque Nacional das Sempre Vivas

Parque Nacional de Anavilhanas

Parque Nacional de São Joaquim

Parque Nacional do Caparaó

Parque Nacional do Descobrimento

Parque Nacional do Itatiaia

Parque Nacional do Pau Brasil

Parque Nacional do Pico da Neblina

Parque Nacional do Superagui

Parque Nacional Histórico do Monte Pascoal

Parque Nacional Marinho de Fernando de Noronha

Parque Nacional Marinho dos Abrolhos

Refúgio de Vida Silvestre de Santa Cruz

Reserva Biológica de Duas Bocas

Reserva Biológica do Atol das Rocas

Reserva Biológica do Tinguá

Reserva Extrativista Chico Mendes

Reserva Extrativista Marinha do Arraial do Cabo